Saling menyerang sejak awal babak kedua, tim tamu, Persiba dikejutkan dengan keputusan wasit. Pada menit ke-52, Persiba diganjar penalti dari wasit Dedi Wahyudi. Wasit asal Denpasar ini menganggap bek Persiba, M Taufiq melakukan pelanggaran kepada Cornelis Kaimu. Sakcie Doe yang ditunjuk sebagai eksekutor tak membuang peluang. Sepakan pelannya mampu mengecoh kiper Wahyu Tri Nugroho.
Selang lima menit, tim tamu mendapat peluang lewat Fortune Udo. Namun tendangannya masih melambung di atas mistar gawang. Persiba kembali mendapat peluang di menit ke-59, sayang tendangan pelan Slamet Nur Cahyo masih mampu digagalkan pemain belakang Persebaya. Hujan yang sempat mengguyur Surabaya membuat stadion Gelora 10 Nopember sedikit licin. Pemain pun sering tergelincir dan kehilangan bola.
Babak kedua memasuki menit ke-62, Persiba harus bermain dengan 10 orang setelah kapten kesebelasan, Wahyu Widi Astanto diganjar kartu merah oleh wasit. Wahyu kedapatan melakukan pelangggaran keras kepada Kaimu. Akibat kartu merah ini, pertandingan sempat terhenti beberapa saat. Dua pemain, yakni Kuncoro dari Persebaya dan Udo dari Persiba terlibat adu fisik. Beruntung tidak berujung pada perkelahian. Meski begitu kedua pemain ini akhirnya mendapat kartu kuning dari wasit Dedy.
Unggul dalam jumlah pemain benar-benar dimanfaatkan Persebaya. Mereka kembali mencetak gol di menit ke-74. Berawal dari umpan Kuncoro kepada Sackie Doe, bola lalu disodorkan ke Kaimu. Tanpa penjagaan ketat, eks pemain Deltras ini mudah saja mengoyak jala Persiba. Unggul 3-1 membuat Persebaya sedikit mengendurkan serangan. Meski mereka kerap menciptakan peluang yang membahayakan gawang Persiba.
Menjelang babak kedua usai, Kaimu kembali menjebol jala Persiba di menit ke-83. Selang satu menit, Persiba akhirnya membalas lewat gol kedua Udo. Gol Udo sekaligus menutup pertandingan ini dengan skor 4-2. Meski menang telak, Persebaya masih 'merugi'. Sebab, ketika bermain di Bantul, Persebaya dicukur Persiba dengan skor telak 5-0.
